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CRISPR/Cas9基因敲除
CRISPR(clustered,regularlyinterspaced,shortpalindromicrepeats)是一種來自細菌降解 入侵的病毒DNA或其他外源DNA的免疫機制。在細菌及古細菌中,CRISPR系統(tǒng)共分成3類,其中Ⅰ類和Ⅲ類需要多種CRISPR相關蛋白(Cas蛋白)共同發(fā)揮作用,而Ⅱ類系統(tǒng)只需要一種Cas蛋白即可,這為其能夠廣泛應用提供了便利條件。
目前,來自Streptococcuspyogenes的CRISPR-Cas9系統(tǒng)應用最為廣泛。Cas9蛋白(含有兩個核酸酶結構域,可以分別切割DNA兩條單鏈。Cas9首先與crRNA及tracrRNA結合成復合物,然后通過PAM序列結合并侵入DNA,形成RNA-DNA復合結構,進而對目的DNA雙鏈進行切割,使DNA雙鏈斷裂。 由于PAM序列結構簡單(5’-NGG-3’),幾乎可以在所有的基因中找到大量靶點,因此得到廣泛的應用。CRISPR-Cas9系統(tǒng)已經成功應用于植物、細菌、酵母、魚類及哺乳動物細胞,是目前最高效的基因組編輯系統(tǒng)。
通過基因工程手段對crRNA和tracrRNA進行改造,將其連接在一起得到sgRNA(singleguideRNA)。融合的RNA具有與野生型RNA類似的活力,但因為結構得到了簡化更方便研究者使用。通過將表達sgRNA的原件與表達Cas9的原件相連接,得到可以同時表達兩者的質粒,將其轉染細胞,便能夠對目的基因進行操作。
作為一種新的基因編輯技術,CRISPR/Cas9有以下特點和優(yōu)勢:
1、靶向精確性更高。RNA靶向序列和基因組序列必須完全匹配,Cas9才會對DNA進行剪切。
2、可實現(xiàn)對靶基因多個位點同時敲除。
3、實驗周期短,最快僅需2個月,節(jié)省大量時間和成本。
4、無物種限制。
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