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2×Universal Blue SYBR Green qPCR Master Mix

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貨號:
SJ21574
產品規(guī)格:
5X1ml
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產品詳情 操作說明 注意事項

產品簡介

本產品是使用SYBR Green I嵌合熒光法進行qPCR反應的專用2×預混液。核心組分Taq DNA Polymerase是基于抗體法封閉的熱啟動DNA聚合酶,能有效抑制低溫條件下的非特異性擴增,同時配以針對qPCR優(yōu)化的反應Buffer,非常適合進行高特異性、高靈敏度的qPCR反應,可以在寬廣的定量區(qū)域內得到良好的標準曲線,對靶基因定量準確、重復性好、可信度高。同時本品中含有特殊的ROX Passive Reference Dye,適用于所有qPCR儀器,無需在不同的儀器上調整ROX濃度。預混液中添加有藍色染料,具有加樣示蹤作用,同時配套提供黃色模板稀釋液,當用黃色模板稀釋液稀釋模板,并將其加入到藍色反應預混液中,顏色由藍色變?yōu)榫G色,能夠對配制反應體系過程起到示蹤作用,防止漏加或錯加。該藍色與黃色染料的光譜與qPCR染料不重疊,不影響反應結果。


儲存與運輸

冰袋(wet ice)運輸;-20℃避光保存,有效期12個月。


組成

Component Number

Component

G3326-01

G3326-05

G3326-15

G3326-1

2×Universal Blue SYBR Green qPCR Master Mix

1 mL

5×1 mL

15×1 mL

G3326-2

40×Yellow Template Dilution Buffer

1 mL

1 mL

1 mL

說明書

1份


操作步驟

1. (可選)模板稀釋

本試劑盒中提供40×Yellow Template Dilution Buffer,即為40倍濃縮的黃色模板稀釋液,可用于模板稀釋,并通過液體顏色改變準確判斷模板是否已經加入到qPCR反應液中。

以20 μL qPCR反應體系為例,根據加入到20 μL qPCR反應液中稀釋后的模板量,對應原始模板稀釋方法可參考下表(以原始模板稀釋至100 μL為例):

稀釋后的模板

加入到20 μLqPCR反應液中的體積(μL)

1

2

3

4

5

6

7

8

100 μL模板稀釋體系中加入

40×Yellow Template Dilution Buffer的體積(μL)

50

25

16.7

12.5

10

8.4

7.2

6.3

原始模板加入到

100 μL模板稀釋體系中的體積(μL)

x

x

x

x

x

x

x

x

補加Nuclease-Free Water的體積(μL)

50-x

75-x

83.3-x

87.5-x

90-x

91.6-x

92.8-x

93.7-x

例:若20 μL qPCR反應體系中加稀釋后模板2 μL以100 μL模板稀釋體系為例,當加入原始模板體積x為20 μL時,需加入25 μL40×Yellow Template Dilution Buffer,補加Nuclease-Free Water 55 μL至總體積100 μL,此時稀釋后模板中40×Yellow Template Dilution Buffer為10×取2 μL此稀釋后的模板加入到20 μL反應體系中,最終40×Yellow Template Dilution Buffer即為1×??傊璞WC在最終的qPCR體系中Yellow Template Dilution Buffer。

注:如模板無需稀釋,或不使用G3326-2模板稀釋液,可忽略此步驟。

2. 推薦qPCR反應體系:

Component

20 μL rxn

50 μL rxn

Final Concentration

2×Universal Blue SYBR Green qPCR Master Mix

10 μL

25 μL

Forward Primer (10 μM)a

0.4 μL

1 μL

0.2 μM

Reverse Primer (10 μM)a

0.4 μL

1 μL

0.2 μM

Templateb

Variable

Variable

as required

Nuclease-Free Water

Add to 20 μL

Add to 50 μL


a.通常引物終濃度為0.2 μM可以得到較好擴增效果。反應性能較差時,可以在0.2-1.0 μM范圍內調整引物濃度。

b.模板添加量因模板溶液中存在的靶基因的拷貝數不同而不同,進行梯度稀釋研討適當的模板添加量。在20 μL反應體系中模板DNA添加量最好在100 ng以下。以RT-PCR反應的cDNA(RT 反應液)為模板時,添加量不要超過PCR反應液總體積的10%。

3. PCR反應程序(可根據機型適當調整):

A. 兩步法

B. 三步法

階段

步驟

循環(huán)數

溫度

時間

階段

步驟

循環(huán)數

溫度

時間

Stage 1

預變性

1

95℃

30 sec

Stage 1

預變性

1

95℃

30 sec

Stage 2

變性

40


95℃


15 sec

Stage 2

變性

40

95℃

15 sec

退火/延伸

60℃

30 seca

退火

55-65℃

10 sec




延伸

72℃

30 seca

Stage 3

熔解曲線

1

儀器默認設置

Stage 3

熔解曲線

1

儀器默認設置

a:若需提高擴增特異性,可使用兩步法程序或提高退火溫度;需提高擴增效率,可使用三步法程序或延長延伸時間。


注意事項

1. 如不需要進行移液追蹤,則不使用40×Yellow Template Dilution Buffer進行模板稀釋。

2. 試劑使用前請上下輕輕顛倒混勻,請勿渦旋振蕩混勻,避免產生氣泡。

3. 配制反應液時,試劑請于冰上放置。

4. 本制品中含有熒光染料SYBR Green,配制PCR反應液時應避免強光照射。

5. 反應液的配制、分裝請使用新的一次性槍頭,盡量避免樣品間的交叉污染。

6. 避免反復凍融Master Mix,解凍后后盡量在一個月內使用完畢。


適配機型

ABI: 5700, 7000, 7300, 7700, 7900, 7900HT, 7900 HT Fast, StepOne?, StepOne Plus?, 7500/7500 Fast, ViiA 7?, QuantStudio? 系列, PikoRealTM Cycler;

Stratagene: Mx3000P?, 3005P?, 4000?;

Bio-Rad: CFX96?, CFX384?, iCycler iQ?, iQ5?, MyiQ?, MiniOpticon?, Opticon?, Opticon 2, Chromo4?;

Eppendorf: Realplex 2s, Mastercycler? ep, realplex;

IIIumina: Eco QPCR;

Cepheid: SmartCycler?;

Qiagen Corbett: Rotor-Gene? 系列;

Roche: LightCycler? 系列;

Takara: Thermal Cycler Dice系列;

Analytikjena: qTOWER系列;

qTOWER: LineGene系列。


引物設計原則

1. 擴增產物長度建議控制在80-300 bp之間;

2. 引物長度:18-25 bp;

3. 引物中堿基G+C含量應在40%-60%之間;

4. 正向引物和反向引物的Tm值相差不超過2℃為佳,Tm值控制在58-62℃為佳;

5. 堿基分布的隨機性;

6. 引物最好不要含有自身互補序列,否則會形成發(fā)夾二級結構;

7. 兩個引物之間不應有多于4個的互補或同源堿基,不然會形成引物二聚體,尤應避免3'端的互補重疊;

8. 建議引物的3'末端堿基為G或C;

9. NCBI上的比對結果無其他非特異性產物出現。


常見問題及解決方法


問題描述

可能原因

解決辦法

反應結束無擴增曲線出現或者Ct值出現過晚

模板濃度過低

減少模板稀釋倍數重復實驗,樣品濃度未知的情況下先從最高濃度做起。

模板降解

重新制備模板,重復實驗。

體系中存在PCR抑制劑

一般為模板帶入,加大模板稀釋倍數或重新制備純度高的模板重復實驗。

引物可能降解

長期未用的引物,應先通過PAGE電泳檢測完整性,以排除其降解的可能。

擴增效率低

提高引物濃度,嘗試三步法擴增程序,或者重新設計引物。

擴增產物過長

擴增產物長度控制在80-300 bp。

空白對照出現信號

反應體系污染

首先更換空白對照的水,如果還發(fā)生同樣情況,繼續(xù)更換引物、吸頭、PCR管或啟用新的Master Mix;

反應體系在超凈工作臺內配制,減少氣溶膠污染。

出現引物二聚體等非特異性擴增

一般在35循環(huán)以后空白對照出現擴增產物屬正常情況,應配合熔解曲線進行分析;

重新設計引物,調整引物濃度或優(yōu)化PCR反應程序。

熔解曲線出現多峰

引物設計不佳

根據引物設計原則重新設計新引物。

引物濃度過高

適當降低引物濃度。

cDNA模板存在基因組污染

提取后的RNA溶液使用DNA酶進行消化,例如:dsDNase,以去除基因組污染,或設計跨內含子引物。

實驗重復性差

加樣誤差大

使用精準的移液器、配合高品質吸頭準確移液;

高倍稀釋模板,加入大體積模板減少加樣誤差;

放大qPCR反應體積。

模板濃度過低

減少模板稀釋倍數重復實驗。

qPCR儀不同位置的溫度偏差

定期校準qPCR儀。

擴增曲線不光滑

熒光信號太弱,經系統校正后產生

確保Master Mix中預混的染料未降解;

更換熒光信號收集更好的qPCR專用耗材。

擴增曲線斷裂或下滑

模板濃度較高,基線的終點值大于Ct值

減小基線終點(Ct值-3),重新分析數據。

個別孔擴增曲線突然驟降

反應管內留有氣泡

確保Mix完全溶解,請勿渦旋振蕩混勻;

加樣完成后輕彈離心去除氣泡;

延長預變性時間至10 min,以去除氣泡。

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